小三通是自2001年1月1日起，海峽兩岸實施的小型三通模式，實現中國大陸福建省與臺灣小規模的通商、通航和通郵。2008年6月19日，擴大小三通方案19日正式公告實施，只要持有兩岸入出境有效證件，就可以從金門或馬祖進出中國大陸。陸委會主委賴幸媛說，擴大小三通是政府照顧金馬地區民眾的一項政策，緩和未來兩岸直航所帶來的影響。擴大小三通方案下午正式公告後，在金門碼頭，一艘戴著200多名乘客的客輪隨即從金門出發，駛往對岸，成為擴大小三通實施後的第一個航班。在擴大案實施後，金馬逐漸發展成為來往兩岸的一個轉運站。但大量非本地旅客利用金馬往來臺灣的航線，造成當地居民購票的困難。另外，由於離島居民購買機票有補助，也吸引臺灣居民遷戶口至金馬地區，導致金門實住人口僅約戶籍人口的一半。